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Guide Gastro-entérologie et Hépatologie

Traitements et soins

Des médicaments à la chirurgie, comprendre ce qui est proposé et pourquoi

Traitements médicamenteux, endoscopie interventionnelle, biothérapies, chirurgie… La prise en charge des maladies digestives a considérablement évolué ces vingt dernières années. Cette page vous aide à comprendre les grandes options thérapeutiques, leurs logiques et ce à quoi vous pouvez vous attendre.

📅 Mis à jour : avril 2026 ✍️ Équipe Hospitalidée 📚 HAS · SNFGE · Assurance Maladie
« Les traitements des maladies inflammatoires de l'intestin ont été révolutionnés par les biothérapies, permettant aujourd'hui à la majorité des patients d'atteindre une rémission profonde et durable. » — Société Nationale Française de Gastro-Entérologie (SNFGE), rapport d'activité 2023

Il n'existe pas un traitement des maladies digestives, mais des traitements très différents selon la pathologie, son stade et le profil du patient. Certaines maladies se gèrent efficacement avec des médicaments simples ; d'autres nécessitent des traitements complexes, des gestes endoscopiques ou une chirurgie. Dans tous les cas, la décision thérapeutique résulte d'une discussion entre vous et votre médecin, éclairée si nécessaire par une réunion de concertation pluridisciplinaire.

Cette page présente les grandes familles de traitements en gastro-entérologie et hépatologie, leurs objectifs et leurs modalités pratiques. Elle ne remplace pas la consultation médicale ni les recommandations personnalisées de votre équipe soignante.

Les traitements médicamenteux

Du simple antiacide aux immunosuppresseurs, la pharmacopée digestive couvre un spectre très large. Comprendre la logique de chaque classe aide à mieux adhérer au traitement.

> 95 %
de guérison de l'hépatite C avec les antiviraux à action directe en 8 à 12 semaines
Source : HAS, 2022
60-70 %
des patients atteints de MICI atteignent une rémission clinique sous biothérapie de première ligne
Source : SNFGE, 2023
80 %
des reflux gastro-oesophagiens sont contrôlés par un traitement par inhibiteurs de la pompe à protons
Source : HAS, 2023
15 M
de patients traités par inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) en France, parmi les médicaments les plus prescrits
Source : Assurance Maladie, 2022
Classe thérapeutique Indications principales Mode d'action
Inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) Reflux gastro-oesophagien, ulcère gastroduodénal, oesophagite Réduction de la sécrétion acide gastrique
Aminosalicylés (5-ASA) Rectocolite hémorragique légère à modérée Anti-inflammatoire local de la muqueuse intestinale
Corticoïdes Poussées de MICI, hépatites auto-immunes Anti-inflammatoire puissant, traitement d'induction
Immunosuppresseurs (azathioprine, méthotrexate) MICI, hépatites auto-immunes en entretien Modulation de la réponse immunitaire
Antiviraux à action directe (AAD) Hépatite C chronique Blocage direct de la réplication virale
Analogues de nucléosides (ténofovir, entécavir) Hépatite B chronique Inhibition de la polymérase virale
Antispasmodiques, régulateurs du transit Syndrome de l'intestin irritable Action sur la motricité intestinale et la douleur

Sources : HAS, Vidal, SNFGE, 2022-2023.

Le saviez-vous ?

Les inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) sont souvent prescrits « le temps que ça passe » et continuent d'être pris des années sans réévaluation. Or, un usage prolongé sans indication validée peut entraîner des carences en magnésium et augmenter le risque d'infections digestives. Une consultation médicale de réévaluation est recommandée au-delà de 8 semaines de traitement continu.

Source : HAS, recommandations bon usage des IPP, 2023

L'endoscopie interventionnelle

L'endoscopie ne sert pas seulement à diagnostiquer : elle permet aussi de traiter de nombreuses lésions digestives sans chirurgie, en accès direct par les voies naturelles.

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Polypectomie et mucosectomie
L'ablation de polypes lors d'une coloscopie est l'acte endoscopique le plus courant, et l'un des plus efficaces pour prévenir le cancer colorectal. La mucosectomie permet de retirer des lésions planes plus étendues. Ces gestes se font sous anesthésie légère, en ambulatoire, sans incision.
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Hémostase endoscopique
En cas de saignement digestif (ulcère hémorragique, varices oesophagiennes), l'endoscope permet d'injecter des agents hémostatiques, de poser des clips, de ligaturer des varices ou d'utiliser la thermocoagulation. Cette prise en charge évite souvent le recours à la chirurgie en urgence.
🫀
CPRE et gestes biliaires
La cholangiopancréatographie rétrograde endoscopique (CPRE) permet d'explorer et de traiter les voies biliaires : extraction de calculs biliaires, pose de prothèses en cas de sténose, sphinctérotomie. Elle associe endoscopie et radiologie dans une même procédure réalisée en milieu spécialisé.
Ambulatoire dans la grande majorité des cas. La plupart des gestes endoscopiques diagnostiques et interventionnels se réalisent en hôpital de jour. Le patient rentre chez lui le soir même. Si une anesthésie générale est utilisée, il faut prévoir un accompagnant pour le retour à domicile.

Les biothérapies et thérapies ciblées

Les biothérapies ont transformé la prise en charge des maladies inflammatoires chroniques de l'intestin. Elles ciblent des mécanismes précis de l'inflammation plutôt qu'agir de façon large sur le système immunitaire.

Contrairement aux traitements conventionnels, les biothérapies sont des anticorps monoclonaux ou des protéines de fusion conçus pour bloquer des molécules spécifiques impliquées dans l'inflammation. En gastro-entérologie, elles sont principalement utilisées dans les MICI réfractaires aux traitements conventionnels.

Anti-TNF (adalimumab, infliximab)

Première classe de biothérapies utilisée dans les MICI depuis les années 2000. Ils bloquent le facteur de nécrose tumorale alpha (TNF-alpha), cytokine clé de l'inflammation. Administrés par perfusion ou injection sous-cutanée, des biosimilaires moins coûteux sont désormais disponibles.

Anti-intégrines (védolizumab)

Ces anticorps agissent spécifiquement sur le tube digestif en bloquant la migration des cellules inflammatoires vers la paroi intestinale. Leur action ciblée sur l'intestin les rend particulièrement intéressants en termes de tolérance systémique, dans la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique.

Anti-IL-12/23 (ustékinumab)

En bloquant deux interleukines pro-inflammatoires (IL-12 et IL-23), l'ustékinumab agit sur une voie différente des anti-TNF, ce qui en fait une option de choix en cas d'échec ou d'intolérance à ces derniers. Il s'administre par perfusion lors de la première dose, puis par injection sous-cutanée.

Inhibiteurs de JAK (tofacitinib, upadacitinib)

Ces petites molécules ciblées prises par voie orale bloquent les voies de signalisation JAK impliquées dans l'inflammation. Leur action rapide en fait des options attractives, notamment dans la rectocolite hémorragique. Ils nécessitent un bilan préalable et une surveillance renforcée. Source : SNFGE, 2023.

Le saviez-vous ?

L'objectif d'une biothérapie n'est pas seulement de faire disparaître les symptômes, mais d'atteindre une « cicatrisation muqueuse » : la disparition des lésions visibles à l'endoscopie. Les patients qui atteignent cet objectif ont nettement moins de rechutes, d'hospitalisations et de recours à la chirurgie à long terme.

Source : SNFGE, recommandations sur les objectifs thérapeutiques dans les MICI, 2022

La chirurgie digestive

Mieux ciblée grâce aux progrès du diagnostic et des traitements médicaux, la chirurgie digestive reste indispensable dans certaines situations : complications, cancers, échec des traitements.

Urgence
Chirurgie en urgence
Péritonite par perforation digestive, occlusion intestinale, hémorragie non contrôlée par endoscopie, colectasie aiguë dans la rectocolite hémorragique… Ces situations nécessitent une intervention rapide. Les progrès de la réanimation et de la chirurgie laparoscopique ont nettement amélioré le pronostic de ces urgences.
MICI
Chirurgie dans les MICI
Environ 30 à 40 % des patients atteints de maladie de Crohn et 20 à 30 % de ceux atteints de rectocolite hémorragique nécessiteront une chirurgie au cours de leur vie. Dans la rectocolite hémorragique, la coloproctectomie totale avec anastomose iléo-anale est curatrice. Dans la maladie de Crohn, la chirurgie vise à traiter les complications (sténoses, fistules, abcès) en préservant un maximum d'intestin. Source : SNFGE, 2022.
Cancers
Chirurgie oncologique digestive
La chirurgie reste le traitement curatif de référence pour la majorité des cancers digestifs localisés (côlon, rectum, estomac, pancréas, foie). Elle est souvent précédée ou suivie d'une chimiothérapie. La chirurgie laparoscopique ou robot-assistée permet des résections précises avec des suites opératoires plus rapides.
Foie
Transplantation hépatique
La greffe de foie est le traitement de dernier recours pour les insuffisances hépatiques terminales (cirrhose décompensée, cancer du foie sur cirrhose, insuffisance hépatique aiguë grave). En France, environ 1 400 transplantations hépatiques sont réalisées chaque année. La survie à 5 ans dépasse 70 % dans les indications bien sélectionnées. Source : Agence de la biomédecine, 2023.
La chirurgie mini-invasive. La majorité des interventions digestives programmées se réalisent aujourd'hui par laparoscopie (chirurgie par petites incisions sous caméra), voire par robot chirurgical. Les suites opératoires sont nettement raccourcies : lever précoce, reprise alimentaire rapide, durée d'hospitalisation réduite.

Le suivi au long cours

Pour les maladies digestives chroniques, le traitement ne s'arrête pas à la prescription. Le suivi régulier est une composante essentielle de la prise en charge.

Que ce soit pour une MICI, une cirrhose, une hépatite chronique ou après un cancer digestif, le suivi spécialisé permet de détecter précocement une rechute, d'ajuster le traitement, de surveiller les effets indésirables et de dépister les complications. La fréquence des consultations et des examens dépend de la pathologie et de son évolution.

Suivi biologique régulier

Bilan hépatique, numération formule sanguine, marqueurs inflammatoires (CRP, calprotectine fécale), dosages de médicaments (thiopurines, biothérapies), sérologies virales… Ces examens permettent d'évaluer l'activité de la maladie et la tolérance du traitement sans recourir systématiquement à l'endoscopie.

Surveillance endoscopique programmée

Coloscopies de surveillance après polypectomie ou cancer colorectal, endoscopies de contrôle dans les MICI pour évaluer la cicatrisation muqueuse, gastroscopies de dépistage de l'oesophage de Barrett… Ces rendez-vous programmés ne doivent pas être différés sans avis médical.

Imagerie et élastométrie hépatique

Pour les maladies chroniques du foie, l'échographie abdominale semestrielle est recommandée en cas de cirrhose. Le FibroScan (élastométrie par ultrasons) permet de mesurer la fibrose hépatique de façon non invasive, en quelques minutes, sans douleur.

Vaccinations et prévention

Les patients sous immunosuppresseurs ou biothérapies ont un calendrier vaccinal spécifique : mise à jour avant l'initiation du traitement, éviction des vaccins vivants en cours de traitement. La vaccination contre l'hépatite B, la grippe et le pneumocoque est particulièrement recommandée. Source : calendrier vaccinal HAS, 2024.

Signes d'alerte à ne jamais ignorer. Sous biothérapie ou immunosuppresseur, certains signes doivent amener à consulter sans délai : fièvre supérieure à 38,5 °C inexpliquée, douleurs abdominales intenses et soudaines, sang abondant dans les selles, jaunisse, confusion ou somnolence inhabituelle. Ces symptômes peuvent signaler une complication sérieuse.

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Questions fréquentes

La question est légitime et fait l'objet d'un suivi rigoureux dans les registres de pharmacovigilance. Les données actuelles, issues de plus de vingt ans de recul sur les anti-TNF, n'ont pas mis en évidence d'augmentation significative du risque de cancers solides. Un risque légèrement accru de lymphome a été observé principalement avec l'association anti-TNF et thiopurines, mais ce risque reste faible en valeur absolue.

Il est important de mettre ce risque en perspective avec le bénéfice thérapeutique : une MICI non contrôlée expose elle-même à des risques sérieux. Le rapport bénéfice-risque est évalué individuellement avec votre médecin. Source : SNFGE, 2023.

Non. L'arrêt brutal des corticoïdes après un traitement prolongé peut provoquer une insuffisance surrénalienne aiguë, potentiellement grave. La décroissance doit toujours suivre un schéma progressif défini par votre médecin, adapté à la durée du traitement et à la dose quotidienne.

Par ailleurs, arrêter les corticoïdes trop rapidement peut entraîner une rechute de la maladie sous-jacente. Si vous ressentez des effets indésirables difficiles à supporter, parlez-en à votre médecin avant toute modification de traitement.

La cicatrisation muqueuse désigne la disparition des lésions visibles à l'endoscopie dans la paroi intestinale, au-delà de la simple amélioration des symptômes. C'est aujourd'hui un objectif thérapeutique majeur dans les MICI, associé à un meilleur pronostic à long terme : moins de rechutes, moins d'hospitalisations, moins de recours à la chirurgie.

La calprotectine fécale (marqueur mesuré dans les selles) est un reflet indirect de l'inflammation de la muqueuse intestinale, utilisé pour orienter les décisions entre deux endoscopies. Source : SNFGE, 2022.

Oui, mais avec des règles précises. Les vaccins inactivés (grippe, pneumocoque, hépatite B, COVID-19, tétanos, polio) sont autorisés et recommandés sous biothérapie ou immunosuppresseurs. En revanche, les vaccins vivants atténués (rougeole-oreillons-rubéole, fièvre jaune, varicelle, BCG) sont contre-indiqués en cours de traitement immunosuppresseur.

Idéalement, le bilan vaccinal doit être mis à jour avant de débuter une biothérapie. Source : calendrier vaccinal HAS, 2024.

Dans la rectocolite hémorragique, la coloproctectomie totale (ablation de l'ensemble du côlon et du rectum) permet de supprimer définitivement la muqueuse malade, ce qui est bien curatrice de la rectocolite hémorragique en tant que telle. La reconstruction s'effectue généralement par anastomose iléo-anale avec réservoir en J, permettant une continence naturelle dans la grande majorité des cas.

Cette chirurgie est lourde et nécessite souvent deux à trois étapes opératoires. C'est une décision qui se prend en concertation avec toute l'équipe médicale et chirurgicale. Source : SNFGE, 2022.

Sources et références

  • HAS : Bon usage des inhibiteurs de la pompe à protons, 2023. has-sante.fr
  • HAS : Protocole national de diagnostic et de soins, Rectocolite hémorragique, 2022. has-sante.fr
  • HAS : Antiviraux à action directe dans l'hépatite C chronique, 2022. has-sante.fr
  • SNFGE : Biothérapies dans les MICI : recommandations de la SNFGE, 2023. snfge.org
  • HAS : Calendrier vaccinal 2024. has-sante.fr
  • Agence de la biomédecine : Rapport annuel transplantation hépatique, 2023. agence-biomedecine.fr
  • Assurance Maladie : Données de remboursement des médicaments, 2022. ameli.fr

Sélection éditoriale Hospitalidée, toutes les sources citées dans ce guide sont accessibles librement en ligne.

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